Fobia er en oppslukende reise i spenning og etterforskning som begynner på et dekadent hotell som domineres av en teknologisk avansert sekt. Sekten forkynner en forening av vitenskap og religion, og utfører i all hemmelighet eksperimenter for å forbedre mennesker ved hjelp av genetiske modifikasjoner og parallelle virkeligheter.

Fortid, nåtid og fremtid kolliderer i et scenario fullt av gåter, mysterier og konspirasjoner. På denne reisen, på jakt etter sannheten, må spilleren utforske de forskjellige verdenene ved hjelp av et kamera og forsvare seg mot monstrøse skapninger som forfølger hotellkorridorene og kjemper for å overleve.