Høyre og ventre håndkontroll til konsollen.
Joy-Con er den nye hådkontrollen till Nintendo Switch og er veldig fleksibel å bruke. Hver Joy-Con har et fullt sett med knapper samt hver sin innbygde accelerometer som gjør dem bevegesesfølsomme. Du kan bruke dem som to kontroller eller sette dem sammen til en stor kontroll ved hjelp av et Joy-Con Grip (Medfølger ikke).
Begge bruker en avansert Rumble HD-funksjon som benytter små subtile vibrasjoner for å gjøre spillet enda mer realistisk. Funksjonen er så nøyaktig at du skulle kunne kjenne isbiter som beveger seg i et glass når du rister Joy-Con.
Den venstre kontrollen har en dedikert knapp til å ta skjermbilder du kan dele med andre. Den høyre har et NFC-punkt som fungerer sammen med Amiibo-figurer. Samme Joy-Con har også et innebygget IR Motion-kamera som kjenner avstand, form og bevegelse hos nærliggende objekter. Kameraet kan f.eks kjenne om hånden er formet som sten, saks eller papir.