Vend tilbake til Gamindustris verden, der Arfoire, den frie verdens forbryter, har beseiret de fire CPU-ene i Gamindustri, og det er nå opp til deres yngre søstre å befri dem fra fangenskapet.Nepgear, CPU-kandidaten til Planeptune og lillesøster til Neptune, begir seg ut på sin søken sammen med IF og Compato for å gjenvinne Gamindustris velstand, stoppe ondskapens syndikat som Arfoire har skapt, og sette søsteren hennes fri! På sine reiser over hele verden vil Nepgear møte nye og gamle venner, møte de andre CPU-kandidatene og ta seg av alle monstre som står i veien for henne i denne klassiske JRPG-fortellingen om det gode mot det onde!