Dårlig Oppdragelse er satt til 80-tallet, når frihetens vinder sveiper gjennom Madrid etter Francos fall. Den unge filmregissøren Enrique Goded får besøk av en mann som hevder å være hans gamle skolekamerat Ignacio. Barndomsvennens novelle om skoletidens skyggeside utløser et skred av minner for Enrique. ”Besøket” handler om forbudt kjærlighet og overgrep ved kostskolen og hvordan den senere rusmisbrukeren og transvestitten Ignacio oppsøker synderen, fader Manolo, for å drive pengeutpressing. Historien roper etter å bli filmet, men det er noe rart med Ignacio, som nå kaller seg Angel. Når Enrique bestemmer seg for å undersøke saken nærmere, blir han viklet inn i en historie som både avdekker, tilslører, fortier og bekjenner...